香港文匯報(bào)訊（記者 莫楠）香港大學(xué)工程學(xué)院團(tuán)隊(duì)利用全港基因數(shù)據(jù)，研發(fā)一項(xiàng)嶄新的基因組追蹤方法，針對(duì)本港河流及污水等城市水體中常見(jiàn)、可產(chǎn)生抗生素耐藥性的大腸桿菌展開(kāi)研究。團(tuán)隊(duì)採(cǎi)用納米孔長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序技術(shù)，分析一年內(nèi)收集的1,016個(gè)大腸桿菌樣本，涵蓋不同細(xì)菌類型、耐藥基因及環(huán)狀質(zhì)粒，以精準(zhǔn)追蹤耐藥細(xì)菌和耐藥基因在本港不同環(huán)境的流動(dòng)和傳播途徑。

研究發(fā)現(xiàn)，不同來(lái)源的細(xì)菌在基因上高度相似，其中142組相同菌株同時(shí)存在於人體與環(huán)境水體中。團(tuán)隊(duì)更識(shí)別出195個(gè)同時(shí)存在於人類、動(dòng)物及環(huán)境的質(zhì)粒，顯示耐藥基因能透過(guò)可移動(dòng)DNA傳播。實(shí)驗(yàn)室實(shí)驗(yàn)證實(shí)，部分質(zhì)?？稍诩?xì)菌間轉(zhuǎn)移，為跨界傳播提供了實(shí)證支持，為公共衛(wèi)生防護(hù)策略提供關(guān)鍵啟示。

這項(xiàng)研究由港大土木工程系教授張彤領(lǐng)導(dǎo)。團(tuán)隊(duì)運(yùn)用納米孔長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序技術(shù)，對(duì)採(cǎi)集的樣本進(jìn)行全面分析，從而實(shí)現(xiàn)全港高解析度的比對(duì)。研究將複雜基因數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為實(shí)用工具，建立創(chuàng)新量化框架，用以測(cè)量細(xì)菌與耐藥基因在不同環(huán)境間的連通性。簡(jiǎn)言之，城市水體已成為細(xì)菌與耐藥基因在人、動(dòng)物與環(huán)境之間混合傳播的交匯點(diǎn)。

團(tuán)隊(duì)表示發(fā)現(xiàn)對(duì)公共衛(wèi)生至關(guān)重要，因當(dāng)環(huán)境相互連通時(shí)，耐藥性將更快在人與環(huán)境間雙向傳播。研究第一作者徐曉慶表示：「微生物耐藥不僅關(guān)乎基因分佈的位置，更關(guān)乎它們?cè)诒舜诉B通的環(huán)境之間如何移動(dòng)。透過(guò)量化人類、動(dòng)物與環(huán)境水體之間的生態(tài)連通性，這項(xiàng)研究有助解釋耐藥性傳播途徑，並為更一體化的監(jiān)測(cè)與干預(yù)策略提供依據(jù)?！?/p>

研究支持建立綜合監(jiān)測(cè)系統(tǒng)，整合污水、環(huán)境及臨床數(shù)據(jù)，協(xié)助決策者及早預(yù)警並優(yōu)先處理高風(fēng)險(xiǎn)質(zhì)粒與菌株。此方法亦適用於其他城市，有助建立標(biāo)準(zhǔn)化基因組監(jiān)測(cè)框架，在「同一健康」理念下評(píng)估及防控抗生素耐藥風(fēng)險(xiǎn)。

本研究獲張彤主持的大學(xué)教育資助委員會(huì)主題研究計(jì)劃資助，該計(jì)劃旨在支持本地資助大學(xué)圍繞戰(zhàn)略重點(diǎn)主題開(kāi)展高水平科研。研究成果已發(fā)表於國(guó)際權(quán)威期刊《自然-通訊》。